南通保洁公司的工作流程如下：
1. 客户预约：保洁公司与客户进行预约，确定服务时间、服务内容等。
2. 清洁准备：保洁公司根据服务内容，准备好相应的清洁工具和化学药剂等。
3. 现场清洁：保洁人员按照清洁流程，对需要清洁的场所进行清洁。
4. 清洁检验：保洁人员对清洁后的场所进行检查，确保清洁质量符合要求。
5. 客户验收：客户对清洁后的场所进行检查，确认清洁质量是否符合要求。
6. 费用结算：保洁公司与客户结算服务费用，并为客户提供发票和收据。
7. 后期维护：保洁公司根据客户要求，对清洁后的场所进行后期维护，保证清洁质量。
以上是南通保洁公司的一般工作流程，具体流程可能会因服务内容、场所等情况而有所不同。